Gli obelischi sono considerati come l’una delle scoperte dell’anno 2024 in biologia! Si tratta di frammenti di RNA recentemente rilevati nel microbiota orale e intestinale.
Autore
José Miguel Soriano del Castillo è cattedratico di Nutrizione e Bromatologia presso il Dipartimento di Medicina Preventiva e Salute Pubblica dell’ Universitat de València .
Dichiarazione di divulgazione
José Miguel Soriano del Castillo non lavora per, non consulta , non possiede azioni in, né riceve finanziamenti da alcuna azienda o organizzazione che potrebbe trarre vantaggio da questo articolo. Inoltre, ha dichiarato di non avere affiliazioni rilevanti oltre al suo incarico accademico.
Partner
L’ Universitat de València è un partner fondamentale in questo progetto, fornendo finanziamenti come membro di The Conversation ES . Questo supporto è essenziale per la ricerca e la divulgazione scientifica, contribuendo a promuovere la comprensione delle scoperte nel campo della biologia e del microbiota.
Lingue
L’articolo è disponibile in francese e spagnolo .
Lingue disponibili
- Francese.
- Spagnolo.
Materiale genetico senza funzione chiara
Recentemente, l’attenzione si è concentrata su elementi di materiale genetico noti come viroidi , che sono piccoli frammenti di RNA circolare privi di involucro proteico e incapaci di codificare per proteine. La ricerca che ha portato alla mappatura del genoma circolare ha rivelato la presenza di frammenti di RNA di tipo viroide. Tra questi, gli “obelischi” si distinguono per la loro unicità. La loro scoperta nelle batterie della bocca e dell’intestino è considerata una delle scoperte più significative dell’anno.
Scoperta e Ricerca
Questa scoperta è stata effettuata dal gruppo di ricerca di Ivan N. Zheludev del dipartimento di biochimica della Stanford University negli Stati Uniti, utilizzando un programma bioinformatico chiamato Viroid Nominator (VNom) applicato ai dati dell’ Integrative Human Microbiome Project (iHMP). Questa nuova classe di agenti a RNA forma un gruppo filogenetico distintivo e inedito, presente in vari ecosistemi microbici, incluso l’intestino umano. Gli obelischi devono il loro nome alla loro struttura secondaria , che è composta principalmente da regioni a forma di bastoncini o obelischi. Si tratta di RNA circolari che codificano per una nuova superfamiglia di proteine, chiamate oblins , la cui funzione rimane sconosciuta.
Importanza della Ricerca
La comunità scientifica sta compiendo progressi significativi nella comprensione degli obelischi. Ad esempio, l’équipe di ricerca di Frederico Schmitt Kremer dell’ Universidade Federal de Pelotas in Brasile ha sviluppato un nuovo strumento bioinformatico, Tormentor , per rilevarli in modo ancora più efficace rispetto al VNom. Un altro gruppo di ricerca della Duke University (USA) ha scoperto che gli obelischi sono ampiamente presenti nelle molecole di RNA di Streptococcus sanguinis SK36 , una comune batteria della placca dentale, sebbene non siano presenti nel suo genoma . Questa scoperta è interessante poiché implica che gli obelischi necessitano di una cellula ospite per replicarsi, in questo caso l’ Streptococcus menzionato.
Persistenza e Implicazioni
In aggiunta, si stima che queste entità biologiche possano persistere negli individui per oltre 300 giorni , suggerendo che potrebbero avere effetti a lungo termine sui loro ospiti. Tuttavia, non è ancora chiaro se la loro presenza sia positiva , neutra o negativa . Questo apre un nuovo campo di studi e solleva la possibilità di ridefinire concetti che potrebbero essere diventati obsoleti, come quello di microbioma .
Microbioma o microgénobioma?
Si stima che il corpo umano ospiti circa 40.000 miliardi di batteri , distribuiti tra i sistemi digestivo , respiratorio , genito-urinario e altri. Questo numero, se confrontato con i circa 30.000 miliardi di cellule che compongono il corpo di un adulto, rende la scoperta degli obelischi potenzialmente fondamentale. Fino ad ora, il concetto di microbioma si limitava ai microorganismi viventi come batteri , virus o funghi , ma l’emergere degli obelischi rende questa definizione incompleta, poiché si tratta di componenti genetici privi di una struttura cellulare propria. È probabile che presto emerga un concetto consensuale che consideri non solo gli obelischi, ma anche altri frammenti genetici noti come sequenze virali endogene . Questi sono resti di virus che sono stati integrati nel DNA umano o che sono presenti nei microorganismi del corpo, ma che non formano virus completi e attivi. Questo cambiamento di paradigma potrebbe significare che ciò che oggi conosciamo come microbioma potrebbe essere ribattezzato microgénobioma .
L’autore britannico Aldous Huxley ha scritto: «C’è un mondo, ma è all’esterno». Forse sarebbe più appropriato dire, alla luce delle recenti scoperte, che «c’è un mondo, ma è dentro di noi».
Fonte: TheConversationFR